海南三亚红树林放线菌多样性及抗菌活性

摘要

目的 研究海南三亚红树林底泥样品中放线菌的多样性及抗菌活性,以期发现可以产生新颖活性物质的药用放线菌资源.方法 采用11种分离培养基以稀释涂布法对样品中的放线菌进行选择性分离;对分离菌株的16S rRNA基因序列进行扩增、比对,开展多样性分析;放线菌发酵液经乙酸乙酯萃取,采用纸片法对粗提物进行抗菌活性筛选;同时对放线菌的生物合成基因NRPS、PKSⅠPKSⅡ进行筛选.结果 共分离到149株放线菌,它们分布于6个目12个科16个属,其中小单孢菌属为优势菌属;菌株MG 16072的16S rRNA基因序列与最近有效菌株Actinomadura hallensis H647-1T的相似率为97.94％,为潜在Actinomadura属新种;抗菌活性检测结果显示,有20株放线菌至少对1株检定菌具有抗菌活性;NRPS、PKSⅠ、PKSⅡ基因筛选结果显示,有82株放线菌至少含有1种生物合成基因.结论 海南三亚红树林含有丰富的药用放线菌资源,具有从中发现新颖活性物质的潜力.