藏猪与大约克猪EDN1基因多态性与表达差异分析

摘要

为探究EDN1基因在猪脂肪沉积机制中所发挥的作用,本实验利用RT-q PCR技术对藏猪及大约克猪心脏、背脂及背最长肌组织中EDN1基因的m RNA表达量进行检测,并采用Sanger测序法对藏猪和大约克猪EDN1基因3’UTR和5’UTR区域进行了单核苷酸多态性(SNPs)筛选与基因分型。结果表明:在不同品种猪中,藏猪心脏组织EDN1基因m RNA表达量显著高于大约克猪;背脂和背最长肌中m RNA表达量的趋势一致,均为藏猪极显著低于大约克猪;在EDN1基因的3’UTR和5’UTR区域,存在3’A15G、3’C56G、3’A348G和5’A-1793G、5’C-1757A共5个突变位点,且藏猪与大约克猪等位基因频率差异显著。经转录因子预测发现,这些SNPs位点与EDN1基因负向调控脂肪沉积性状相关。该实验结果为进一步探究猪EDN1基因在脂肪沉积性状方面的研究奠定了基础。