鸭瘟病毒dUTPase基因的分子特性及转录时相分析

摘要

应用大量生物信息学分析工具及RNA斑点杂交技术对本实验室构建鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)CHv株基因文库时新发现的dUTPase基因(GenBank登录号DQ486149)进行了分子特性及转录时相分析.研究表明:该基因大小为 1344bp,编码447个氨基酸,包含dUTPase家族蛋白的5个保守motifs,排列形式3-1-2-4-5具备Ⅱ型dUTPase的典型特征.DPV CHv dUTPase基因在25个疱疹病毒参考株之间高度保守,并与α疱疹病毒的氨基酸同源性较之与β、γ疱疹病毒要高.DPV CHv dUTPase基因转录检测发现DPV感染宿主细胞后最早30min可检测到该基因转录产物,随后转录产物量迅速放大,4h达高峰,24h后下降至相对低的水平.该研究为阐明病毒基因表达调控机理提供了有用的实验数据,并对病毒其他基因的发现和研究具有指导性意义.