采用染色质免疫沉淀联合芯片技术分析胃癌全基因组蛋白H3K27三甲基化水平

摘要

目的:研究胃癌细胞全基因组蛋白H3K27的三甲基化水平.方法:收集我科2007年10月-2008年1月间8例胃癌患者的病灶组织和正常胃黏膜组织,采用染色质免疫沉淀联合芯片技术(ChIP-chip)在全基因组范围内对两种组织细胞的组蛋白H3K27进行高通量的检测.随后采用染色质免疫沉淀一实时定量聚合酶联反应(ChIP-qPCR)验证芯片结果,定量反转录聚合酶联反应(qRT-PCR)检测H3K27显著差异基因的mRNA表达水平.用统计软件进行基因筛选.结果:经两种组织细胞组蛋白H3K27三甲基化水平对比,筛选出234个基因存在H3K27显著差异,肿瘤细胞中有71个基因显示有H3K27三甲基化程度增高,161个基因H3K27甲基化程度降低;ChIP-qPCR验证结果与CpG岛芯片检测结果一致.结论:和正常胃黏膜组织细胞相比,胃癌细胞多个基因组蛋白H3K27三甲基化存在显著改变.ChIP-chip检测技术有利于进一步揭示胃癌发生的分子机制,发现新的基因治疗靶点.