地黄超氧化物歧化酶(SOD)基因的克隆和生物学特性分析

摘要

以地黄金九(03-2)叶片为材料,根据美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中其他植物SOD基因设计简并引物,通过RT-PCR方法扩增出一个459 bp片段,该基因编码含152个氨基酸。采用生物信息学方法对该基因编码产物的二级结构、理化性质、亲水性/疏水性等方面进行预测分析。结果表明:克隆得到的基因为地黄SOD基因,该基因对应蛋白属于非跨膜的非分泌性亲水蛋白,二级结构具有54.61%的无规则卷曲,30.26%的延长链,9.21%的β-转角和5.92%的α-螺旋,与其他植物的SOD基因序列组成、蛋白性质结构等方面均具有高度相似性。该研究结果为进一步研究地黄SOD基因的表达和功能奠定了基础。