玉米ZmAGA3的生物信息学及基因表达特性分析

摘要

α-半乳糖苷酶(α-Galactosidase)属于糖苷水解酶家族,是棉子糖(RFO)分解代谢过程中的关键酶。为了探究玉米α-半乳糖苷酶基因ZmAGA3在玉米生长发育及应对非生物逆境过程中的功能,对玉米ZmA⁃GA3(alkaline alpha-galactosidase 3)基因及其编码的蛋白质进行了生物信息学预测分析,并研究了ZmAGA3在不同非生物胁迫处理下的表达模式。结果表明,ZmAGA3编码747个氨基酸,相对分子质量81155.05,理论等电点(PI)6.59,总平均亲水性-0.146。ZmAGA3具有AmyAc_family结构域(淀粉酶催化结构域),主要由α-螺旋(26.77%)和无规则卷曲(42.97%)构成;可能发生磷酸化的位点共有46个,主要集中在丝氨酸上;与高粱、狗尾草的亲缘关系更近,与拟南芥和水稻的亲缘关系较远;在外源PEG、ABA、NaCl、H_(2)O_(2)的处理下,ZmA⁃GA3基因的表达量均发生了上调。因此,ZmAGA3基因可能在响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用,这为进一步揭示ZmAGA3基因的功能奠定了基础。