新疆塔里木河叶尔羌高原鳅遗传多样性研究

摘要

为探究新疆塔里木河叶尔羌高原鳅(Triplophysa yarkandensis)遗传多样性现状,研究基于线粒体Cytb和D-loop序列对塔里木河两条支流(车尔臣河和渭干河)的8个地理群体进行了遗传学多样性和遗传结构分析。结果显示,基于Cytb和D-loop序列分别获得了41和51个单倍型,单倍型多样性指数/核苷酸多样性指数分别为0.9247±0.0124/0.9776±0.0032和0.0065±0.0034/0.0115±0.0058,表明各群体的遗传多样性水平均较高。AMOVA结果显示,遗传变异主要来自群体内部(Cytb F_(st)=96.57%;D-loop F_(st)=95.25%),仅有3.43%(Cytb)和4.75%(D-loop)来自群体间;各群体间的遗传距离值小,遗传分化指数F_(st)值低,属于弱分化水平。基于样本构建的系统发育树和单倍型构建的网络进化图均显示,各群体的样本没能形成明显的地理聚群和谱系结构。虽然两支流群体间存在潜在的遗传障碍,并发生了一定的遗传分化,但其遗传距离值只在0.05附近(Cytb,F_(ct)=0.0540;D-loop,F_(ct)=0.0471)。种群历史动态分析结果表明,叶尔羌高原鳅种群相对稳定,未经历过明显的扩张。综合上述结果,塔里木河叶尔羌高原鳅群体遗传多样性水平较高,但是遗传分化主要来源于群体内部,群体间有明显的基因交流,建议将其作为一个保护管理单元进行保护。研究为叶尔羌高原鳅种质资源开发利用、制定合理的保护措施提供了基础数据。