蛋白质中较频繁发生的β发夹结构（β—Hairpins）模式──蛋白质超二级结构（MOTIF）研究（Ⅲ）

摘要

分析了２４０个分辨率在２．５Ａ以上的高精度蛋白结构，研究了α螺旋和β折叠的连接短肽中的β发夹结构模式。首先对较频繁发生的超二级结构组中的Ｅ—ｌｏｏｐ—Ｅ［１］（即β回折结构－βＴｕｒｎ）进行了分析，对每一种β回折结构的氢键长度进行了计算，然后将其模型化。在对β发夹模型化的分析中，同时考虑了连接短肽的长度和氢键模式两个因素。找出了在２４０个蛋白样本库中较常发生的β发夹结构的模式。该结果对结构比较模型、Ｘ衍射晶体结构的解析，以及β发夹结构的预测有一定意义。