高可扩展性的肿瘤精准医学数据库及查询系统的设计与实现

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致谢

摘要

1绪论

1．1研究背景

1．1．1癌症治疗与精准肿瘤学

1．1．2癌症组学分析及方法

1．1．3肿瘤精准医疗现状及问题

1．2研究内容

2精准医学数据库系统

2．1样本库

2．1．1数据来源

2．1．2数据模型与内容

2．2精准医学知识库

2．2．1 OncoKB

2．2．2 PharmGKB

2．3参考信息库

2．4匹配结果库

2．5小结

3精准医学知识查询系统

3．1系统架构

3．2需求分析

3．3系统建模

3．3．1数据体系结构

3．3．2应用体系结构

3．4算法设计与实现

3．4．1算法流程

3．4．2 ANTLR介绍

3．4．3 VQL语法定义

3．4．4 VQL语言的解析

3．4．5 VQL语义执行

3．4．6报告生成

3．5小结

4变异临床解读报告与实例

4．1临床报告

4．1．1报告内容

4．1．2报告规则

4．2报告实例

4．3小结

5总结与展望

5．1总结

5．2展望

参考文献

作者简历