英汉缩略语名词对照
前言
第一部分 结直肠癌关键基因的筛选与鉴定
引言
1 材料
1.1 样本及数据来源
1.2 主要试剂与耗材
1.3 主要仪器与设备
1.4 主要工作液的配制
2 方法
2.1 本部分实验总体流程
2.2 生物信息学分析
2.3 荧光实时定量PCR验证
2.4 统计学方法
3 结果
3.1 TCGA临床数据的有效性
3.2 差异表达基因的筛选
3.3 差异表达基因的染色体分布及聚类分析
3.4 差异表达基因的功能分析
3.5 构建CRC相关差异基因的互作网络
3.6 核心子网及关键基因鉴定
3.7 验证关键基因在转录水平上的表达情况
3.8 CRC关键基因表达的临床意义
4 讨论
第二部分 关键基因PHLPP2在结直肠中的表达及其预后分析
引言
1 材料
1.1 样本及数据来源
1.2 主要试剂与耗材
1.3 主要仪器与设备
1.4 主要工作液的配制
2 方法
2.1 本部分实验总体流程
2.2 组织芯片的构建
2.3 免疫组化
3 结果
3.1 关键基因转录与蛋白表达的相关性分析
3.2 PHLPP2在CRC及癌旁组织中的表达
3.3 XinChao和CQMU两组CRC队列临床数据的主成分分析
3.4 合并队列临床病理及随访数据的准确性检验
3.5 组织中PHLPP2表达与临床病理因素的关系
3.6 PHLPP2表达与CRC患者总体生存的关系
3.7 PHLPP2表达与临床病理因素的单因素及多因素Cox分析
3.8 比较不同临床病理因素与PHLPP2表达的预后评估准确性
3.9 构建CRC总体生存Nomogram预测模型
3.10 比较不同临床病理因素及整合临床病理因素与Nomogram模型的预后评估准确性
4 讨论
第三部分 PHLPP2对结直肠癌生物学行为的影响及机制研究
引言
1 材料
1.1 主要试剂与耗材
1.2 主要仪器与设备
1.3 主要工作液的配制
1.4 细胞株及慢病毒表达载体
1.5 动物来源
2 方法
2.1 本部分实验总体流程
2.2 Western blot检测蛋白的表达
2.3 PHLPP2过表达与敲减稳转细胞系的构建与鉴定
2.4 全转录组测序及生物信息分析
2.5 验证干性
2.6 划痕愈合实验
2.7 Transwell迁移侵袭实验
2.8 荷瘤裸鼠模型的建立
3 结果
3.1 PHLPP2在CRC传代细胞系中的表达
3.2 慢病毒转染及过表达/敲减效果鉴定
3.3 靶向差异表达PHLPP2后的全转录组分析
3.4 PHLPP2可能通过Nrf2-AER通路发挥对生物学功能的主要调控作用
3.5 过表达PHLPP2对CRC细胞系ROS水平的影响
3.6 干扰PHLPP2表达对CRC细胞系中CD133+细胞比例的影响
3.7 过表达PHLPP2对CRC细胞干性特征的影响
3.8 过表达PHLPP2对CRC细胞侵袭转移及致瘤能力的影响
3.9 PHLPP2对CRC干性标志物及Nrf2表达的影响
3.10 PHLPP2对CRC干性标志物的表达调控具有Nrf2依赖性
4 讨论
全文总结
参考文献
文献综述:氧化还原调控与肿瘤干细胞
致谢
攻读学位期间研究成果
