景宁木兰AP1同源基因的克隆及序列分析

摘要

本实验以景宁木兰(Magnolia sinostellata)嫩叶为实验材料,根据转录组数据库中AP1(APETALA1)基因的保守序列信息,通过PCR方法克隆景宁木兰AP1基因,将其命名为MsAP1,运用在线生物信息学分析工具对MsAP1进行序列分析.结果表明:MsAP1基因全长1080bp,开放阅读框(ORF)为729bp,编码242个氨基酸.通过ProtParam ExPASy在线软件分析景宁木兰AP1蛋白质分子式为C1226H1984N364O376S10,分子量28160.05Da,理论等电点PI值为8.95.不稳定指数为61.21,属于不稳定蛋白质.蛋白氨基酸序列比对和系统发育进化分析结果表明MsAP1与同一科属植物的同源性最高,与红花玉兰(Magnolia wufengensis)、广玉兰(Magnolia grandiflora)、皱叶木兰(Magnolia praecocissima)分别达到100％、99％、93％;氨基酸序列保守性分析发现,第90～171个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K-box区域,表明该片段为AP1基因.MsAP1基因的克隆与序列分析对于进一步了解景宁木兰成花机理具有重要意义.