基于转录组测序的SSR位点在不同倍性白姜花株系多态性分析

摘要

研究姜花二倍体形成四倍体过程中与mRNA对应的DNA序列上的SSR是否发生变异,为探索四倍体白姜花性状发生变化可能的遗传机制奠定基础.在前期转录组测序基础上,统计SSR位点,设计特异SSR引物,提取二倍体和四倍体白姜花的叶片DNA进行PCR扩增和测序,分析比较SSR位点在两者之间的差异.结果表明:10个SSR位点核心序列为(AG)n,7个SSR位点在四倍体和二倍体上基因型一致,未发生变异;3个杂合位点基因型尚不能判断.同时,在3个SSR位点筛选出A＞C或者A＞G的SNP,而且在四倍体和二倍体姜花植株中相同.