中国不同山系大熊猫西氏贝蛔虫的遗传分化研究

摘要

本研究对采集自大熊猫主要栖息的三个山系(邛崃山系32个、岷山山系18个和秦岭山系6个)的56条大熊猫西氏贝蛔虫虫体进行了线粒体Cytb、ND1、ATP6、COX1基因和12S共6个基因的全序列扩增、克隆及测序,并经序列比对确定其变异位点、计算种群核苷酸多样性、单倍型数以及单倍型多样性.通过Arlequin 4.0软件的中性检验,计算出Tajima'D和Fu's Fs.最后利用Network 4.6构建单倍型图,用2分析单倍型间的进化关系.具体分析结果如下:Cytb基因:48个样品的Cyt b全序列长度为1107bp,含31个变异位点只有转换,没有颠换、缺失、无插入.在48个样品中,共检出有16个单倍型(H1-H16),经Network4.6软件构建单倍型网络图发现H1、H2是三个山系共有单倍型且H1为优势单倍型,H6、H8是岷山山系及邛崃山系共有型；而H4、H5和H7是岷山山系特有单倍型,H8是秦岭山系独有单倍型,H9-H16是邛崃山系特异单倍型；单倍型多样性(Hd)为0.8440,核苷酸多样性(π)为0.00201.经Arlequin 4.0软件分析表明三个山系的种群遗传结果不明显,即无遗传结构分化.