利用转录组高通量测序进行萝卜抽薹开花相关miRNA及靶基因鉴定

摘要

MicroRNA(miRNA)是一类内源的非编码小分子RNA,在植物生长发育过程起调控作用.本研究通过高通量测序技术,利用萝卜营养生长和生殖生长期叶片构建两个sRNA文库,以鉴定萝卜抽薹开花相关miRNA.结果显示,在两个文库中共鉴定出134个已知miRNA和62个新型miRNA,分属于35和38个miRNA家族.差异表达分析鉴定到66个抽薹开花相关miRNA,包括42个已知和24个新型miRNA.利用qRT-PCR技术对9个miRNA及8个靶基因表达模式进行了验证;对43个miRNA家族的128个潜在靶基因进行了功能注释和分析,结果表明许多功能基因参与了萝卜抽薹开花过程和生长发育.本研究结果为解析miRNA介导的萝卜抽薹开花调控网络机制提供了重要参考.