水牛ELF5基因的克隆鉴定,组织表达谱分析及多态性检测

摘要

目的：为了阐明水牛ELF5基因的结构、基因与水牛泌乳的相关性以及牛科物种ELF5基因的序列差异和群体遗传特征. 方法：本研究采用RT-PCR和电子克隆技术水牛ELF5基因进行了分离鉴定和组织表达谱分析,运用PCR-SSCp技术与DNA直接测序的方法对91份水牛、普通牛、牦牛和大额牛样品ELF5基因的编码区序列进行群体变异检测. 结果：水牛ELF5基因的CDS为768bp,编码255个氨基酸,各物种间的ELF5蛋白的氨基酸序列同源度较高;在水牛非泌乳期和泌乳期间,ELF5基因主要在水牛乳腺、胃、肺、脾、心和肝中表达,其在乳腺组织的表达量最高,且泌乳期的表达量是非泌乳期的1.8倍;在水牛ELF5基因的编码区共检测到11个SNp位点,其中SNP255和SNP461分别在河流型和沼泽型水牛中纯合,其他9个SNp为河流型和沼泽型水牛共享,SNP460和SNP461导致p.G154S和p.G154n氨基酸的异义替换,但对其蛋白功能无显著影响. 结论：研究结果提示,水牛ELF5基因在乳腺发育、生长及其泌乳活动中承担重要角色,ELF5蛋白在牛科物种间高度保守性,预示着水牛ELF5基因在生物体的发育和分化中可能承担着重要的功能.