两种芋兰属植物Ls基因的克隆与序列分析

摘要

LATERAL SUPPRESSOR(Ls)是GRAS家族参与植物分生组织发育的转录因子,是控制植物分枝的关键基因.本研究基于青天葵(Nervilia fordii)转录组数据库,应用RACE-PCR技术克隆青天葵分枝发育相关基因Ls,命名为NfLs(登录号:KJ584362).该序列包含了1191bp的开放阅读框,共编码396个氨基酸.广布芋兰(Nervilia aragoana Gaud.)为青天葵的同属植物,形态、生长习性与广布芋兰均极为相似.以青天葵、广布芋兰(Nervili aragoana Gaud.)基因组DNA为模板,同源克隆获得青天葵NfLs、广布芋兰NaLs基因组序列,分别与NfLs编码序列一致性达100％和99％,两基因翻译成氨基酸序列完全一致,Ls基因在该物种内高度保守.通过与其他物种比对,发现LS基因在这些物种间碱基一致性为63％-75％,氨基酸序列一致性为37％-54％,保守性一般.