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FM-index算法加速压缩文件字符串查找的性能测试及并行化初探

摘要

本文概括介绍了FM-index压缩查询技术,详细阐述了FM-index的工作流程,描述了实现计算字符串在压缩文本中出现次数的算法.对FM-index的源代码在Linux平台上进行了测试,从测试结果分析了使用FM-index进行压缩查询的优点和不足.在最后给出了加快FM-index压缩速度的一个并行化算法的初步设计思路.

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