缢蛏线粒体DNACOI基因序列变异及群体遗传结构分析

摘要

利用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基(COI)基因序列片段对江浙闵地区缢蛏野生群体(江苏射阳—WS、浙江象山—WX,福建霞浦—WP)和养殖群体(江苏射阳—CS、浙江象山—CX、福建漳湾—CZ)的遗传结构进行初步分析.以特异引物进行PCR扩增,经纯化、测序、同源序列比对获得长度为556bp的核苷酸序列,其中A+T含量为66.2％,显著高于G+C含量.在缢蛏六群体98个个体中共检测到了56个单倍型和66个核苷酸多态位点,多态位点比例为11.7％.野生群体的平均核苷酸差异数和核昔酸多样性指数略高于养殖群体,但是野生群体和养殖群体的单倍型多态性指数均大于0.9,其单倍型较为丰富.此外,六群体均有各自特有的单倍型,但只有野生射阳群体与其他群体无共享单倍型,具有鉴定该群体的特异碱基序列.遗传距离和聚类结果显示,养殖群体与野生象山群体和野生霞浦群体间亲缘关系较近.