利用ChIP-on-0chip筛选TEF-1转录因子下游靶基因并进行验证

摘要

染色质免疫共沉淀(ChIP)技术是基于体内分析发展起来的方法，是研究细胞内蛋白质与基因组上特定区域相互作用的强有力工具，它与DNA芯片技术相结合(ChIP-on-chip)，可用于高通量的筛选转录因子的未知DNA靶点。TEF-1是一个重要的转录因子，在肌肉特异基因的表达中起着比较重要的作用，TEF-1的TEA结构域不但能与肌肉特异基因的M-CAT元件作用，还能与其他因子的MADS结构域作用调节其它的肌肉基因的表达。因此筛选TEF-I在骨骼肌中的下游靶基因并揭示它们之间的调控机制意义重大，目前尚未有此类研究的报道。本研究用于染色质免疫共沉淀分析(ChIP)的骨骼肌组织样采自成年昆明小白鼠，样品保存于液氮中，以备ChIP实验。